MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 44292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	TAT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975458
2	NC_010278	TCT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975458
3	NC_010278	ACTC	2	8	250	257	25 %	25 %	0 %	50 %	165975458
4	NC_010278	TTG	2	6	276	281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975458
5	NC_010278	TCG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975458
6	NC_010278	T	6	6	331	336	0 %	100 %	0 %	0 %	165975458
7	NC_010278	CGG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975458
8	NC_010278	TC	3	6	402	407	0 %	50 %	0 %	50 %	165975458
9	NC_010278	AGC	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975458
10	NC_010278	AGA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
11	NC_010278	CCAA	2	8	516	523	50 %	0 %	0 %	50 %	165975458
12	NC_010278	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975458
13	NC_010278	CGG	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975458
14	NC_010278	TTA	2	6	623	628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975458
15	NC_010278	CGGT	2	8	633	640	0 %	25 %	50 %	25 %	165975458
16	NC_010278	GTG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975458
17	NC_010278	CGCT	2	8	761	768	0 %	25 %	25 %	50 %	165975458
18	NC_010278	TGA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975458
19	NC_010278	AAG	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
20	NC_010278	AAG	2	6	822	827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
21	NC_010278	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975458
22	NC_010278	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975458
23	NC_010278	GAA	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
24	NC_010278	TGA	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975458
25	NC_010278	GAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
26	NC_010278	A	6	6	1221	1226	100 %	0 %	0 %	0 %	165975458
27	NC_010278	ACA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975458
28	NC_010278	CTCGTC	2	12	1293	1304	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	165975458
29	NC_010278	CGG	2	6	1369	1374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975458
30	NC_010278	AAG	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
31	NC_010278	ATT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010278	ACA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975459
33	NC_010278	AGC	2	6	1566	1571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975459
34	NC_010278	TAA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975459
35	NC_010278	AGC	2	6	1761	1766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975459
36	NC_010278	GAA	2	6	1782	1787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975459
37	NC_010278	GTTA	2	8	1796	1803	25 %	50 %	25 %	0 %	165975459
38	NC_010278	GCT	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975459
39	NC_010278	ATTTA	2	10	1820	1829	40 %	60 %	0 %	0 %	165975459
40	NC_010278	TGAT	2	8	1918	1925	25 %	50 %	25 %	0 %	165975459
41	NC_010278	ACGG	2	8	2019	2026	25 %	0 %	50 %	25 %	165975459
42	NC_010278	TTA	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975459
43	NC_010278	GTGA	2	8	2130	2137	25 %	25 %	50 %	0 %	165975459
44	NC_010278	GT	3	6	2176	2181	0 %	50 %	50 %	0 %	165975459
45	NC_010278	GTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975459
46	NC_010278	TGCG	2	8	2308	2315	0 %	25 %	50 %	25 %	165975459
47	NC_010278	GCGT	2	8	2344	2351	0 %	25 %	50 %	25 %	165975459
48	NC_010278	AAG	3	9	2401	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975459
49	NC_010278	TGG	2	6	2524	2529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975459
50	NC_010278	GCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975459
51	NC_010278	TTA	2	6	2584	2589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975459
52	NC_010278	ATT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010278	ATC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975460
54	NC_010278	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975460
55	NC_010278	TC	3	6	2711	2716	0 %	50 %	0 %	50 %	165975460
56	NC_010278	TAATTT	2	12	2734	2745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975460
57	NC_010278	TTG	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975460
58	NC_010278	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	165975460
59	NC_010278	CGGT	2	8	2809	2816	0 %	25 %	50 %	25 %	165975460
60	NC_010278	ATT	2	6	2843	2848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975460
61	NC_010278	AGA	2	6	2860	2865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975460
62	NC_010278	TGA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975460
63	NC_010278	GGTC	2	8	2907	2914	0 %	25 %	50 %	25 %	165975460
64	NC_010278	A	6	6	2924	2929	100 %	0 %	0 %	0 %	165975460
65	NC_010278	TTA	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975460
66	NC_010278	TGCG	2	8	3237	3244	0 %	25 %	50 %	25 %	165975460
67	NC_010278	TTTTCG	2	12	3430	3441	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	165975460
68	NC_010278	TG	3	6	3498	3503	0 %	50 %	50 %	0 %	165975460
69	NC_010278	GAT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975460
70	NC_010278	CAA	2	6	3725	3730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975460
71	NC_010278	TAAA	2	8	3742	3749	75 %	25 %	0 %	0 %	165975460
72	NC_010278	A	6	6	3747	3752	100 %	0 %	0 %	0 %	165975460
73	NC_010278	T	6	6	3772	3777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010278	ATTT	2	8	3789	3796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010278	TGA	2	6	3809	3814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975461
76	NC_010278	CGC	2	6	3815	3820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975461
77	NC_010278	ACCGCC	2	12	3834	3845	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	165975461
78	NC_010278	T	6	6	3921	3926	0 %	100 %	0 %	0 %	165975461
79	NC_010278	AAT	2	6	3976	3981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975461
80	NC_010278	GTT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975461
81	NC_010278	TTTC	2	8	4094	4101	0 %	75 %	0 %	25 %	165975461
82	NC_010278	TACCG	2	10	4206	4215	20 %	20 %	20 %	40 %	165975461
83	NC_010278	GTT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975461
84	NC_010278	T	6	6	4290	4295	0 %	100 %	0 %	0 %	165975461
85	NC_010278	ATGATC	2	12	4296	4307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165975461
86	NC_010278	AAT	2	6	4339	4344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975461
87	NC_010278	TG	3	6	4406	4411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010278	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010278	TAG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010278	AAAT	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010278	TTC	2	6	4658	4663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975462
92	NC_010278	GAA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975462
93	NC_010278	A	7	7	4750	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	165975462
94	NC_010278	ACGA	2	8	4793	4800	50 %	0 %	25 %	25 %	165975462
95	NC_010278	A	6	6	4930	4935	100 %	0 %	0 %	0 %	165975462
96	NC_010278	CGG	2	6	4954	4959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975462
97	NC_010278	CGG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975462
98	NC_010278	GGTGCG	2	12	5057	5068	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	165975462
99	NC_010278	CAT	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975462
100	NC_010278	CCGA	2	8	5201	5208	25 %	0 %	25 %	50 %	165975462
101	NC_010278	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975462
102	NC_010278	AGA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975462
103	NC_010278	CAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975462
104	NC_010278	TG	3	6	5357	5362	0 %	50 %	50 %	0 %	165975462
105	NC_010278	A	6	6	5411	5416	100 %	0 %	0 %	0 %	165975462
106	NC_010278	ATT	2	6	5444	5449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975462
107	NC_010278	GCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975462
108	NC_010278	CGGT	2	8	5547	5554	0 %	25 %	50 %	25 %	165975462
109	NC_010278	ATT	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975462
110	NC_010278	AAT	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975462
111	NC_010278	ATTA	2	8	5677	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010278	A	7	7	5711	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010278	TTAT	2	8	5735	5742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010278	TGT	2	6	5775	5780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010278	ATA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010278	CGC	2	6	5851	5856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975463
117	NC_010278	CCA	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165975463
118	NC_010278	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	165975463
119	NC_010278	TTA	2	6	5985	5990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975463
120	NC_010278	ATC	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975463
121	NC_010278	CTT	2	6	6088	6093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975463
122	NC_010278	CGTT	2	8	6102	6109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010278	GATT	2	8	6120	6127	25 %	50 %	25 %	0 %	165975464
124	NC_010278	ACG	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975464
125	NC_010278	GA	3	6	6250	6255	50 %	0 %	50 %	0 %	165975464
126	NC_010278	CGT	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975464
127	NC_010278	CCG	2	6	6378	6383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975464
128	NC_010278	TAA	2	6	6455	6460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975464
129	NC_010278	GTTT	2	8	6495	6502	0 %	75 %	25 %	0 %	165975464
130	NC_010278	TGA	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975464
131	NC_010278	GTT	2	6	6688	6693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975464
132	NC_010278	TTTA	2	8	6737	6744	25 %	75 %	0 %	0 %	165975464
133	NC_010278	CCG	2	6	6757	6762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975464
134	NC_010278	AAT	2	6	6858	6863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975464
135	NC_010278	T	7	7	6919	6925	0 %	100 %	0 %	0 %	165975464
136	NC_010278	TCAA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010278	TAA	2	6	7036	7041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010278	AAT	2	6	7055	7060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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